2025年4月、入管手続きに関わる在留資格や永住申請の手数料が値上げされる見通しとなり、多くの申請予定者や企業関係者に影響が及ぼうとしています。

外国人の雇用や在留を支援する現場では、「どの手続きにいくらかかるのか？」「費用が上がる前にできることは？」といった声が高まっています。

この記事では、改定の背景や対象手続きごとの具体的な金額変更、免除の条件、行政書士報酬との違いまで、手数料に関する最新情報を網羅的に解説。

さらに、企業や個人が損をしないための注意点やトラブル回避策も紹介します。

「申請コストを抑えつつ、確実に手続きを進めたい」

そんな方に役立つ実践的な情報をお届けします。

入管手数料の最新情報と2025年の改定動向

2025年4月から、出入国在留管理庁が定める各種手続きの手数料が一斉に改定されました。

在留資格の変更や更新、永住申請など、多くの申請者に関係する変更です。

物価の上昇や行政コストの増大を背景に、45年ぶりに見直された今回の改定。この記事では、改定の背景や主な変更点、今後の値上げ可能性について詳しく解説します。

2025年4月からの手数料改定の背景とは

今回の改定は、1981年の制度創設以来、約45年ぶりの抜本的な見直しです。

主な背景には以下の3点が挙げられます。

• 物価上昇と人件費増加 – これまで据え置かれていた手数料が、行政運営コストに見合わなくなっていたことが指摘されていました。

   

• オンライン申請の本格導入 – 電子申請制度の導入・普及により、窓口業務の負担とコストの差が明確化。これにより、窓口申請とオンライン申請で手数料が分けて設定されるようになりました。

   

• 行政のデジタル化対応費 – システム保守・運用コストも手数料に反映されています。

政府は「受益者負担の公平性確保」と「業務効率化の促進」を同時に進めるための措置と位置付けています。

参照：在留手続等に関する手数料の改定 | 出入国在留管理庁

主な手数料の変更点一覧（在留資格・永住・再入国など）

2025年4月1日以降に申請される手続きについては、以下のように改定されました。

なお、在留資格認定証明書交付申請は引き続き無料で申請可能です。

重要な注意点として、2025年3月31日までに申請が完了していれば、許可日が4月以降であっても旧手数料が適用されます。

手続きの時期によって支払い金額が異なるため、スケジューリングは慎重に行う必要があります。

今後のさらなる値上げの可能性と議論状況

2025年の改定により一定の調整は行われたものの、今後も手数料の見直しが行われる可能性があります。

• 現時点では追加の改定発表はなし：ただし、物価・人件費の今後の動向次第では、数年単位で再改定の議論が進む可能性は十分にあります。

   

• 電子申請のさらなる推進：今回の改定では、オンライン申請の方が安価に設定されている点が注目されました。将来的には、行政側の業務負担軽減と効率化を促進するために、オンライン申請の優遇措置が強化されることも想定されます。

   

手数料の制度は外国人や企業にとってコストの予測に直結する要素。その変動には今後も注視が必要です。

申請予定者が今すぐできる対策とは

手数料改定により申請コストが上がった今、申請予定者が取れる具体的な対策は主に以下の3つです。

まずはオンライン申請に対応している手続きであれば、オンラインでの申請を優先しましょう。

窓口より500円程度安くなるケースが多く、負担軽減につながります。

次に、早めにスケジュールを立てることも重要です。

更新日ギリギリになると必要書類の準備やオンライン環境の確保が間に合わず、結果的に高額な窓口申請を選ばざるを得なくなることもあります。

最後に、行政書士や専門家に事前相談するのも有効です。

特に複雑な在留資格や変更申請を検討している場合、ミスや再申請のリスクを避けることで、結果的にコストを抑えられるケースがあります。

■手数料改定を正しく理解して、損のない申請を

今回の2025年改定では、在留資格の変更・更新をはじめ、広範な申請手続きで手数料が引き上げられました。
オンライン申請が一部安価に設定されたことで、申請方法の選択がより重要になってきます。

申請時期・方法・在留資格の種類によって、支払う金額に差が生じる点を踏まえ、次のアクションを取る際には必ず最新の公式情報を確認し、適切なタイミングでの申請を心がけましょう。

不安な場合は行政書士など専門家への相談も選択肢の一つです。無駄な支出や手間を減らすためにも、改定情報をしっかり押さえ、賢く対応していきましょう。

在留資格ごとの申請手数料一覧と金額目安

在留資格に関する手続きは多岐にわたり、それぞれで支払うべき手数料が異なります。

このセクションでは、「在留期間の更新」「資格変更」「永住許可」「帰化申請」「再入国許可」などの手続き別に実際の申請費用と注意点を整理し、申請前に把握しておくべき金額と支払い方法のポイントを詳しく解説します。

在留期間の更新にかかる費用

在留資格の期間が近づいた外国人が行う最も一般的な手続きが在留期間更新許可です。

申請時の手数料は次の通りです。

• 窓口申請：6,000円

   

• オンライン申請：5,500円

更新手続きは在留期限の3か月前から可能です。

早めにスケジュールを立てることで、混雑や不備による再申請のリスクを下げられます。

また、在留カードの更新と混同しないよう注意が必要です。

在留資格変更手続きにかかる費用

たとえば「留学」から「就労（技術・人文知識・国際業務）」へ変更する場合や、「家族滞在」から「永住者の配偶者等」へ変更するケースでは、在留資格変更許可申請を行います。

• 窓口申請：6,000円

   

• オンライン申請：5,500円

変更理由の妥当性や在留資格の審査内容により、補足書類の提出が求められることがあります。

変更申請は一発勝負となることが多いため、正確な資料と事前準備が重要です。

永住許可・帰化申請・再入国許可の費用

永住許可申請や再入国許可（1回・数次）は、長期的に日本に滞在するうえで必要な手続きです。

• 永住許可申請：10,000円（オンライン申請は不可）

   

• 再入国許可（1回限り）：4,000円（オンライン：3,500円）

   

• 再入国許可（数次）：7,000円（オンライン：6,500円）

   

• 帰化申請（法務局所管）：無料（但し、戸籍取得費など実費が発生）

永住許可に限らず、審査に時間がかかる手続きほど、書類不備によるやり直しリスクが大きくなります。

正確性と過去の在留履歴の安定性が問われる点にも留意が必要です。

手数料の支払い方法と注意点（収入印紙・現金不可など）

入管関連の手数料は、原則として現金での支払いができず、収入印紙の貼付が必要です。申請書に手数料分の印紙を貼ることで支払いとみなされます。

• 収入印紙は法務局や一部の郵便局で購入可能

   

• 貼り間違いや金額誤りでの再提出は手間と時間のロス

   

• オンライン申請の場合はクレジットカードやPay-easyで支払いが可能なケースあり

収入印紙の剥がれ・破損・消印漏れがあると無効となるため、申請書貼付時には丁寧に処理しましょう。

■申請内容ごとの費用感と事前準備が成功の鍵

在留資格関連の手続きでは、どの手続きにいくらかかるかを事前に把握し、必要な金額を間違いなく準備することが基本です。
申請費用を過小に見積もると、再申請による時間的・金銭的ロスが発生します。
特に初めての申請や期限が迫っている方は、事前に公式サイトの料金表や収入印紙の販売場所を確認し、スムーズな申請につなげましょう。

手数料が免除されるケースや軽減措置について

入管に支払う手数料は原則として定められた額を負担する必要がありますが、一部の申請については免除や軽減措置が適用される場合もあります。

このセクションでは、災害時や特例的な事情による免除、配偶者ビザや未成年などの軽減措置、さらには再申請時の再納付義務について解説します。

災害・特別措置などによる免除の事例

地震や台風などの大規模災害の被災者が在留資格の手続きを行う場合、手数料が免除される特例措置が設けられることがあります。

たとえば、東日本大震災や熊本地震の際には、該当地域に住む外国人の在留手続きに関して免除措置が発表されました。

また、新型コロナウイルス感染拡大時にも、一定の在留手続きについて費用の一部免除や提出期限の延長措置が取られたことがあります。

こうした免除は一時的な対応であることが多いため、法務省入国管理局や出入国在留管理庁の公式発表を常に確認しておくことが重要です。

未成年や配偶者ビザでの軽減・特例措置

未成年の申請者や、日本人・永住者の配偶者ビザに該当する方については、一部の申請において手数料の軽減措置が認められる場合があります。

たとえば、未成年の扶養者を目的とした「家族滞在」ビザの更新などで、申請内容と家族構成、収入状況等を総合的に勘案し、減免されることがあります。

ただし、これらの軽減措置は一律に適用されるものではなく、個別の事情に基づき判断されるため、行政書士や専門家に相談しておくと確実です。

申請ミスによる再提出時の手数料再納付の有無

最も注意すべきポイントが、申請ミスや不備による再提出時の取り扱いです。

以下のようなケースがあります。

• 審査中の軽微な補足書類の提出 → 再納付は不要

   

• 許可が下りた後に重大な誤りが発覚した場合 → 再申請となり、再納付が必要

   

• 手数料の収入印紙が破損・貼付ミスなど形式不備 → 印紙が無効となるため、再度購入が必要

また、電子申請時の通信トラブルや操作ミスによる提出不備も、原則として利用者の責任とされるため、送信完了前の確認が極めて重要です。

■免除・軽減の適用には明確な基準と確認が必要

入管手続きの手数料は原則有料ですが、災害時・未成年・配偶者等の例外においては免除や軽減措置が受けられる可能性があります。
また、申請ミスによる再提出でも状況により再納付が必要なケースがあるため、事前の確認と正確な書類作成がトラブル回避のカギとなります。
制度は流動的な側面もあるため、公式サイトの最新情報を参照しながら、必要に応じて専門家へ相談することが安心です。

行政書士に依頼する場合の手数料と報酬相場

在留資格の申請や更新など、入管に関する手続きを行政書士に依頼するケースは多くあります。

その際に発生するのが、「報酬」と「実費（＝入管手数料）」の2つの費用です。

依頼前にしっかり把握しておきたい相場感や、適正価格を見極めるポイント、複数手続き時の割引例まで詳しく解説します。

入管手続きにおける行政書士報酬の一般的な金額帯

行政書士に入管業務を依頼した場合、報酬額は業務の種類や地域によって幅があります。

おおよその相場は以下のとおりです。

これはあくまで一般的な相場であり、事務所によって価格帯は異なります。

料金が明示されているか、追加料金の有無などもあわせて確認しましょう。

報酬と実費の違いを明確に理解する

行政書士に支払う費用には、主に次の2種類があります。

• 報酬 – 行政書士が作成・提出代行するサービスの対価（書類作成・相談・提出代行など）

   

• 実費 – 入管に支払う法定手数料（収入印紙）や交通費、郵送代など

たとえば、在留資格の更新で「報酬 – 3万円」「手数料 – 6,000円（入管）」で合計36,000円＋税といった形になります。

この区別を曖昧にしている事務所もあるため、内訳をきちんと確認することが大切です。

安すぎる・高すぎる報酬設定に注意すべき理由

報酬額が極端に安い場合は、

• サポートが限定的（相談回数が少ない、電話のみ）

   

• 書類の確認が甘い、ミスが起きやすい

   

• 結局、追加オプションで高額になる

などの質的リスクやトラブルが起こりやすい傾向があります。

一方で、相場以上に高額な料金を提示されるケースでは、

• ブランド力や実績によるプレミアム価格

   

• 外国語対応・全国対応など特殊条件が含まれる

   

• 成功報酬制のため、着手金＋成果報酬の分割請求

など、理由の説明があるかどうかが判断基準となります。

報酬額の高さよりも、提供内容とのバランスや信頼性を見極めましょう。

複数案件をまとめて依頼する際の割引例

家族全員分のビザ更新や、永住申請と資格変更を同時に依頼する場合など、複数案件を一括で依頼すると、割引が適用されるケースもあります。

• 例1：本人＋配偶者の更新申請 → 2件目以降を30%オフ

   

• 例2：更新＋就労資格証明書の同時依頼 → 総額から1万円引き

   

• 例3：複数人の雇用ビザ一括対応 → 個別対応より1人あたり5,000円安

こうした割引が適用されるかどうかは事務所ごとに異なるため、見積もり依頼の段階で明確に確認するのがポイントです。

■報酬の透明性と業務内容のバランスを見極めよう

行政書士に入管手続きを依頼する際は、費用の内訳（報酬＋実費）を明確に把握し、相場と照らし合わせることが重要です。
安さだけで選ぶのではなく、対応範囲・信頼性・丁寧さなど、総合的なサービス内容を見て判断しましょう。
複数の案件をまとめて依頼することで割引が得られることもあるため、見積もりは複数取り、納得できる形で依頼を進めることが成功のカギです。

手数料改定が企業に与える影響とは

2025年4月の入管手数料改定により、外国人雇用を行う企業の人材コストが確実に上昇することが予想されます。

とくに複数名の在留資格更新や資格変更を行う企業では、一人あたり数千円の差が全体で数十万円のコスト増に直結することも。

ここでは、企業側が見落としがちな影響と、事前に取るべき対策を整理します。

外国人雇用を行う企業のコスト増加リスク

今回の手数料改定では、在留期間更新・資格変更などの申請手数料が4,000円から6,000円に引き上げられました。これは一件あたりわずかな差のように見えても、

• 年間で複数人の更新を行う製造・介護・IT業界では、

   

• 企業全体で10万円以上の負担増になるケースも少なくありません。

特に技能実習から特定技能・技人国などへの資格変更が集中する企業では、1人の人材に複数回の手続きが伴うため、累積的なコスト増が無視できないレベルに達します。

加えて、行政書士などへの依頼費用（報酬＋実費）も実質的に上昇することになり、経費精算の見直しや予算配分の再検討が求められます。

人事・労務部門が準備すべき社内対応

手数料の改定は、企業の人事・労務部門に以下のような対応を求めます。

• ビザ更新予定者のスケジュール管理
  　誰がいつ更新するのか、事前に把握しておくことが重要です。

   

• 手数料改定前の駆け込み更新の可能性を検討
  　改定直前の申請であれば旧料金が適用されるため、2025年3月31日までの申請を積極的に活用するのも有効です。

   

• 費用の見積もり・稟議ルートの整備
  　経理・財務部門と連携し、申請費用を含む年間予算に反映させるフローの見直しが求められます。

また、従業員本人が自己負担している企業では、改定の影響を周知し、事前の説明責任を果たすことも必要です。

人材確保のために企業が取るべきコスト管理手法

単に「手数料が上がったから費用が増える」ではなく、企業側の工夫でコストを抑える選択肢もあります。

• オンライン申請を推進し、窓口申請との差額を回避
  在留資格のオンライン申請では、500円程度の手数料割引が適用されるケースがあります。

   

• 同時申請の活用（更新＋資格証明など）で手続き回数を減らす

   

• 行政書士事務所との顧問契約・一括契約による割引
  継続的な依頼を前提とした割引プランを活用することで、長期的なコスト最適化が期待できます。

さらに、社内でのビザ管理ツールの導入や、期限アラートなどの仕組み化によって、人的ミスによる再申請・再納付のリスクも抑制できます。

■コスト上昇を「戦略的対応」で乗り越える

入管手数料の改定は企業にとって避けられないコスト増ではありますが、事前のスケジュール管理・申請形式の工夫・パートナー選びによって負担を最小限に抑えることが可能です。
人材確保と定着を進める中で、費用面のマネジメントも「戦略の一部」として考える姿勢が、これからの企業に求められる重要なポイントとなるでしょう。

知らないと損する！手数料トラブルを避けるポイント

在留資格の更新や変更申請を行う際、「必要な手数料を支払えば手続きは終わり」と思っていませんか？

実は、手数料の支払い方や添付方法を間違えると申請が受理されない、あるいは再提出になるリスクがあります。

とくに2025年の改定以降、収入印紙の金額ミスや電子申請時の支払いトラブルが増えているため注意が必要です。

このセクションでは、よくあるミスとその対策を紹介します。

印紙の貼り間違い・記入ミスによる再提出例

紙申請の場合、多くの手続きで収入印紙を使って手数料を納付します。

ところが、

• 旧料金の印紙を誤って使用した

   

• 台紙に正しく貼り付けていなかった

   

• 申請書に手数料の記載がなかった

といった形式上のミスで、申請が差し戻されるケースが後を絶ちません。

特に2025年4月の改定後は、金額が複雑になったこともあり、古い情報を参照して旧料金の印紙を使ってしまうトラブルが急増しています。

窓口で発見された場合はその場での修正もできますが、郵送申請では数日〜数週間の遅延になる恐れもあるため、申請前に最新の手数料額と印紙の取り扱い方法を必ず確認しましょう。

電子申請時の支払いミス・申請中断のリスク

オンライン申請でも手数料の納付は必須ですが、ここにも落とし穴があります。

• ログイン後の支払い画面で金額選択を誤る

   

• 支払い完了前にブラウザを閉じてしまいエラーになる

   

• ネット環境が不安定で処理が中断される

こうしたトラブルにより、手数料だけが引き落とされ、申請が未完了のまま止まる事例が報告されています。

また、申請の「やり直し」が必要になると、再度ログイン・資料アップロード・電子署名といった手間がかかるため、申請者にとっては大きなストレスになります。

対応策としては、申請中は通信環境を安定させ、エラー表示が出た際は必ずスクリーンショットを保存し、入管のサポート窓口にすぐ連絡を取るようにしましょう。

領収証の保存義務と証拠書類としての扱い

意外と見落としがちなのが、手数料納付後に発行される領収証（収入印紙台紙や納付書）の取り扱いです。

これらは以下の理由から一定期間の保管が推奨されます。

• 申請の証拠として提出を求められることがある

   

• 行政書士や社内担当者が複数手続きを同時に行う際、申請漏れや重複防止に必要

   

• トラブル発生時、支払済みであることの証明として使える

とくに企業が申請を代行している場合、領収証の管理は社内監査や会計処理にも関わる重要な書類です。

可能であればスキャン保存や管理台帳への記録を徹底しましょう。

■手数料支払いは「正確さ」と「記録」がカギ

手数料の支払いは一見単純に見えて、金額・方法・書類の扱い方に一つでもミスがあると申請自体が無効になる可能性があります。
とくに2025年の手数料改定後は金額体系が変わり、過去の知識で進めるとトラブルに直結します。
だからこそ、「最新情報の確認」「支払い証明の保管」「エラー時の迅速対応」が、入管手続きをスムーズに進めるポイントとなるのです。

入管手数料の正確な理解がスムーズな申請の第一歩

2025年の手数料改定により、在留資格の更新・変更・永住申請・再入国許可など、幅広い手続きで費用が上昇しました。

加えて、オンライン申請と窓口申請で金額が異なる点や、収入印紙による支払い限定などの条件も押さえておく必要があります。

今回の記事では、

• 手数料の改定背景と金額の一覧

   

• 在留資格別の費用と支払い方法

   

• 免除・軽減措置の条件

   

• 行政書士に依頼する場合の費用相場

   

• 企業が受ける影響と社内の対応策

   

• トラブルを防ぐ支払い時の注意点

といった観点から、申請者・企業双方に役立つ情報を網羅して解説しました。

手数料は「単なる支払い項目」ではなく、申請の成否やコスト管理にも関わる重要な要素です。

申請前には最新情報を確認し、ミスなく進めることが求められます。とくに多国籍人材を受け入れる企業や、永住を検討する個人は、制度変更の動向にも注目して、準備と対策を進めましょう。

今後も入管制度はオンライン化・デジタル化の流れの中で変化し続けることが予想されます。

正確な理解と柔軟な対応が、円滑な在留資格維持と手続きの成功に直結します。